ถั่วลิสงเป็นหนึ่งในที่สุดสารก่อภูมิแพ้อาหารทั่วไป การแพ้ถั่วลิสงอาจเป็นอันตรายถึงชีวิตและบางครั้งถั่วลิสงถือเป็นสารก่อภูมิแพ้ที่รุนแรงที่สุด ผู้ที่เป็นโรคภูมิแพ้ควรหลีกเลี่ยงถั่วลิสงและผลิตภัณฑ์จากถั่วลิสงทั้งหมด

สารอะฟลาทอกซินเป็นสารที่ก่อให้เกิดโรคมะเร็ง วิธีที่หลีกเลี่ยงสารอะฟลาทอกซินสำหรับผู้บริโภคคือเลือกถั่วที่สดใหม่ ไม่เป็นรา

ถั่วทุกชนิดมีกรดไฟติกหรือไฟเทต ซึ่งเป็นสารที่ปกป้องเมล็ดพืชจากการถูกทำลาย ร่างกายไม่สามารถย่อยสารนี้ได้ บางครั้งทานเข้าไปเลยมีอาการอืด ไม่ย่อย และลมเยอะ แถมเจ้าสารนี้ยังยับยั้งการดูดซึมแร่ธาตุที่มีประโยชน์เช่น เหล็ก สังกะสี และแคลเซียม

การทานถั่วซึ่งมีไฟเบอร์เยอะมากเกินไปสามารถทำให้เกิดแบคทีเรียในท้องที่ทำให้ราลมเยอะเพราะฉะนั้น แต่เราควรรู้วิธีทานจะได้ไม่ท้องอืดและท้องผูก

ถั่วลิสงมีสารต้านอนุมูลอิสระจำนวนมากซึ่งเป็นสารที่ทำให้การดูดซึมสารอาหารของคุณแย่ลงและลดคุณค่าทางโภชนาการ

ในบรรดาสารต้านอนุมูลอิสระในถั่วลิสงมีกรดไฟติก ซึ่งกรดไฟติกช่วยลดการมีธาตุเหล็กและสังกะสีในถั่วลิสงลดคุณค่าทางโภชนาการลงเล็กน้อย